材料科学实验教学中心实行学校与学院两级管理模式。学校负责制定中心建设的各项政策、实验室整体规划、教学指导和教学质量监督等工作，并提供实验教学运行、实验室建设、仪器设备维修维护等经费。学院负责中心人员配备，制定相关规章制度及具体运行管理工作。目前，中心设主任一名，负责实验中心的全面管理，设副主任一名，负责日常管理、设备管理、实验教学管理与改革、实践教学环节管理等，设专职实验技术人员4名，负责金相制备、冶金物化等分实验室管理。
中心负责实验教学安排的统一编排和组织实施。每学期，中心根据人才培养方案，依据教学大纲，利用学校实践教学管理系统，合理考虑教师和时间的基础上安排实验课表。实验指导教师均由具有主讲教师资格的教师或实验技术人员担任，首次指导实验的教师事先需对实验项目进行试做，合格后方可指导实验。为保证实验教学效果，实验课程原则上每20名学生配备1名指导教师。同时，校院两级督导、分管教学副院长、中心主任等不定期对实验教学过程进行巡查，对教学过程和教学情况进行检查、督促。
在完成正常教学任务的前提下，中心积极对实验室进行开放共享。秉持“面向全体、因材施教、注重实效、形式多样”的原则，把实验室开放共享工作作为教学改革的重要内容，鼓励和支持广大教师将教学、科研成果转化为实验教学内容，将先进的教学手段和教学思想引入实验教学，强化对学生创新能力的培养。
中心抓住验收通过省级实验教学示范中心的契机，中心争取在日常管理，实验教学水平，科研能力等上一个新台阶，充分考虑中心的实际情况，结合学校和学院“十三五”、“十四五”发展规划，制定中心发展规划。
